Istituto Tumori Bari

"Giovanni Paolo II" I.R.C.C.S.

Team Composition

Team Leader: Maria Carmela Vegliante, PhD –SC Ematologia IRCCS

Team members: Sabino Ciavarella, Giacomo Loseto, Carla Minoia, Maria Stella De Candia, Antonio Negri, GianMaria Zaccaria, Grazia Gargano, Paolo Mondelli, Anita Pappagallo, Fabio Pavone, Felice Clemente

Work program

L'avvento dell’immunoterapia e delle terapie cellulari nella pratica clinica delle neoplasie ematologiche ha reso necessaria una migliore comprensione del microambiente tumorale (TME) in termini di composizione e funzione cellulare. Tuttavia, lo studio del TME risulta complesso per due ragioni principali: i) l'eterogeneità fenotipica/funzionale del TME all'interno dello stesso paziente e tra i pazienti con la stessa patologia e ii) la difficoltà di conciliare i dati biologici e clinici nel contesto di studi clinici controllati e nella pratica clinica del mondo reale.

L'attività di ricerca del Laboratorio di Diagnostica Ematologica e Terapia Cellulare è da tempo dedicata all'applicazione di approcci bioinformatici e matematici all'avanguardia per la dissezione in-silico del microambiente, sfruttando i big data pubblici per generare e validare ipotesi prognostico/predittive in diverse neoplasie ematologiche. Tale approccio è strettamente interconnesso con un'attività retrospettiva/prospettica di raccolta di dati interni (clinici e biologici) di coorti del mondo reale, nonché con la centralizzazione di campioni di pazienti reclutati in studi clinici multicentrici.

Negli ultimi anni, l’attività di ricerca del gruppo ha fornito grandi quantità di risultati nel campo del linfoma diffuso a grandi cellule B e del microambiente, identificando firme molecolari dal valore prognostico validati con la tecnologia NanoString, potenzialmente applicabile alla pratica clinica. Queste scoperte consentono la concettualizzazione di nuovi razionali di immunoterapia per pazienti ad alto rischio. Ulteriori linee di ricerca mirano a ottimizzare la diagnostica dei sottotipi di linfoma rari mediante la trascrittomica e a produrre nuovi strumenti predittivi per altre neoplasie ematologiche.

Team Network

• Department of Mathematics, University of Bari Aldo Moro, 70125 Bari, Italy
• FIL, Fondazione Italiana Linfomi
• Division of Diagnostic Haematopathology, European Institute of Oncology, IRCCS, Milan, Italy.
• August Pi i Sunyer Biomedical Research Institute (IDIBAPS) and Hospital Clinic, Barcelona Spain.
• Hematology Unit and Translational Research Laboratory, Azienda USL-IRCCS, Reggio Emilia, Italy.
• Tumor Immunology Unit, Department of Sciences for Health Promotion and Mother-Child Care "G. D'Alessandro,", University of Palermo, Palermo, Italy

Key publication

• NR1H3 (LXRα) is associated with pro-inflammatory macrophages, predicts survival and suggests potential therapeutic rationales in diffuse large b-cell lymphoma.

Vegliante MC, Mazzara S, Zaccaria GM, De Summa S, Esposito F, Melle F, Motta G, Sapienza MR, Opinto G, Volpe G, Bucci A, Gargano G, Enjuanes A, Tabanelli V, Fiori S, Minoia C, Clemente F, Negri A, Gulino A, Morello G, Scattone A, Zito AF, Tommasi S, Agostinelli C, Vitolo U, Chiappella A, Barbui AM, Derenzini E, Zinzani PL, Casadei B, Rivas-Delgado A, López-Guillermo A, Campo E, Moschetta A, Guarini A, Pileri SA, Ciavarella S. Hematol Oncol. 2022 Jul 18.

• Prognostic value of lesion dissemination in doxorubicin, bleomycin, vinblastine, and dacarbazine-treated, interimPET-negative classical Hodgkin Lymphoma patients: A radio-genomic study.

Durmo R, Donati B, Rebaud L, Cottereau AS, Ruffini A, Nizzoli ME, Ciavarella S, Vegliante MC, Nioche C, Meignan M, Merli F, Versari A, Ciarrocchi A, Buvat I, Luminari S.Hematol Oncol. 2022 May 23.

• Spatial transcriptome of a germinal center plasmablastic burst hints at MYD88/CD79B mutants-enriched diffuse large B-cell lymphomas.

L'Imperio V, Morello G, Vegliante MC, Cancila V, Bertolazzi G, Mazzara S, Belmonte B, Mangogna A, Balzarini P, Corral L, Lopez G, Di Napoli A, Facchetti F, Pagni F, Tripodo C.Eur J Immunol. 2022 Aug;52(8):1350-1361.

• Electronic case report forms generation from pathology reports by ARGO, automatic record generator for onco-hematology.

Zaccaria GM, Colella V, Colucci S, Clemente F, Pavone F, Vegliante MC, Esposito F, Opinto G, Scattone A, Loseto G, Minoia C, Rossini B, Quinto AM, Angiulli V, Grieco LA, Fama A, Ferrero S, Moia R, Di Rocco A, Quaglia FM, Tabanelli V, Guarini A, Ciavarella S.Sci Rep. 2021 Dec 10;11(1):23823.

• Predictive and Prognostic Molecular Factors in Diffuse Large B-Cell Lymphomas.

Pileri SA, Tripodo C, Melle F, Motta G, Tabanelli V, Fiori S, Vegliante MC, Mazzara S, , Derenzini E. Cells. 2021 Mar 18;10(3):675.

• A New Ensemble Method for Detecting Anomalies in Gene Expression Matrices.

Laura Selicato, Flavia Esposito, Grazia Gargano, Maria Carmela Vegliante, Giuseppina Opinto, Gian Maria Zaccaria, Sabino Ciavarella, Attilio Guarini, Nicoletta Del Buono. Mathematics, 2021-04 | Journal article.

• 18F-FDG PET/CT Cannot Substitute Endoscopy in the Staging of Gastrointestinal Involvement in Mantle Cell Lymphoma. A Retrospective Multi-Center Cohort Analysis. Skrypets T, Ferrari C, Nassi L, Margiotta Casaluci G, Puccini B, Mannelli L, Filonenko K, Kryachok I, Clemente F, Vegliante MC, Daniele A, Sacchetti G, Guarini A, Minoia C. J Pers Med. 2021 Feb 13;11(2):123.
• Primary, Bilateral and Diffuse Renal Non-Hodgkin's Lymphoma in a Young Woman Suffering from Turner Syndrome. Rossini B, Skrypets T, Minoia C, Quinto AM, Zaccaria GM, Ferrari C, Maggialetti N, Mastrorosa A, Gatti P, Casiello M, Ciavarella S, Guarini A. J Pers Med. 2021 Jul 7;11(7):644.
• Hodgkin Lymphoma: A Special Microenvironment.

Opinto G, Agostinelli C, Ciavarella S, Guarini A, Maiorano E, Ingravallo G. J Clin Med. 2021 Oct 12;10(20):4665.

• Intra-tumour heterogeneity of diffuse large B-cell lymphoma involves the induction of diversified stroma-tumour interfaces.

Sangaletti S, Iannelli F, Zanardi F, Cancila V, Portararo P, Botti L, Vacca D, Chiodoni C, Di Napoli A, Valenti C, Rizzello C, Vegliante MC, Pisati F, Gulino A, Ponzoni M, Colombo MP, Tripodo C. EBioMedicine. 2020 Nov;61:103055.

• A Spatially Resolved Dark- versus Light-Zone Microenvironment Signature Subdivides Germinal Center-Related Aggressive B Cell Lymphomas.

Tripodo C, Zanardi F, Iannelli F, Mazzara S, Vegliante M, Morello G, Di Napoli A, Mangogna A, Facchetti F, Sangaletti S, Chiodoni C, VanShoiack A, Jeyasekharan AD, Casola S, Colombo MP, Ponzoni M, Pileri SA. iScience. 2020 Sep 16;23(10):101562.

• The Tumor Microenvironment of DLBCL in the Computational Era.

Opinto G, Vegliante MC, Negri A, Skrypets T, Loseto G, Pileri SA, Guarini A, Ciavarella S. Front Oncol. 2020 Mar 31;10:351.

• Diffuse large B-cell lymphoma: the stuff of cell-of-origin and microenvironment.

Pileri SA, Vegliante MC, Ciavarella S. Oncotarget. 2019 Jun 18;10(40):3991-3993.

• Dissection of DLBCL microenvironment provides a gene expression-based predictor of survival applicable to formalin-fixed paraffin-embedded tissue.

Ciavarella S, Vegliante MC, Fabbri M, De Summa S, Melle F, Motta G, De Iuliis V, Opinto G, Enjuanes A, Rega S, Gulino A, Agostinelli C, Scattone A, Tommasi S, Mangia A, Mele F, Simone G, Zito AF, Ingravallo G, Vitolo U, Chiappella A, Tarella C, Gianni AM, Rambaldi A, Zinzani PL, Casadei B, Derenzini E, Loseto G, Pileri A, Tabanelli V, Fiori S, Rivas-Delgado A, López-Guillermo A, Venesio T, Sapino A, Campo E, Tripodo C, Guarini A, Pileri SA.

Ann Oncol. 2018 Dec 1;29(12):2363-2370.

• SOX11 promotes tumor protective microenvironment interactions through CXCR4 and FAK regulation in mantle cell lymphoma.

Patricia Balsas, Jara Palomero, Álvaro Eguileor, Marta Leonor Rodríguez, Maria Carmela Vegliante, Ester Planas-Rigol, Marta Sureda-Gómez, Maria C Cid, Elias Campo, Virginia Amador. Blood. 2017 Jul 27; 130(4):501-513.

• SOX11 defines two different subtypes of mantle cell lymphoma through transcriptional regulation of BCL6.

J Palomero, M C Vegliante, A Eguileor, M L Rodríguez, P Balsas, D Martínez, E Campo, V Amador. 2016 Jul; 30(7):1596-9.

• SOX11 promotes tumor angiogenesis through transcriptional regulation of PDGFA in mantle cell lymphoma.

Jara Palomero, Maria Carmela Vegliante, Marta Leonor Rodríguez, Alvaro Eguileor, Giancarlo Castellano, Ester Planas-Rigol, Pedro Jares, Inmaculada Ribera-Cortada, Maria C Cid, Elias Campo, Virginia Amador. Blood. 2014 Oct 2; 124(14):2235-47.

• SOX11 regulates PAX5 expression and blocks terminal B-cell differentiation in aggressive mantle cell lymphoma.

Maria Carmela Vegliante, Jara Palomero, Patricia Pérez-Galán, Gaël Roué, Giancarlo Castellano, Alba Navarro, Guillem Clot, Alexandra Moros, Helena Suárez-Cisneros, Sílvia Beà, Luis Hernández, Anna Enjuanes, Pedro Jares, Neus Villamor, Dolors Colomer, José Ignacio Martín-Subero, Elias Campo, Virginia Amador. Blood. 2013 Mar 21; 121(12):2175-85. Plenary paper.